R/refdb_filter.R
refdb_filter_seq_stopcodon.RdFilter sequences based on their number of of stop codons.
refdb_filter_seq_stopcodon(x, max_stop = 0, code, codon_frame = NA)a reference database.
maximum number of stop codons.
an integer indicating the genetic code to use for translation (see genetic-codes).
an integer giving the nucleotide position where
to start translation. If NA (the default), the three different frames
are tested and the frame producing the lowest number of stop codons will
be used.
A tibble (filtered reference database).
lib <- read.csv(system.file("extdata", "baetidae_bold.csv", package = "refdb"))
lib <- refdb_set_fields_BOLD(lib)
refdb_filter_seq_stopcodon(lib, code = 5)
#> source sequenceID markercode phylum_name class_name order_name
#> 1 BOLD 7208675 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 2 BOLD 7208674 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 3 BOLD 11680869 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 4 BOLD 11680870 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 5 BOLD 11680871 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 6 BOLD 11680872 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 7 BOLD 11680873 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 8 BOLD 11680874 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 9 BOLD 9698877 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 10 BOLD 9698882 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 11 BOLD 9698874 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 12 BOLD 9698867 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 13 BOLD 9698881 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 14 BOLD 9698879 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 15 BOLD 9698876 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 16 BOLD 9698878 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 17 BOLD 9698868 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 18 BOLD 9698869 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 19 BOLD 9698870 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 20 BOLD 9698866 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 21 BOLD 9698873 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 22 BOLD 9698880 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 23 BOLD 9698871 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 24 BOLD 9698884 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 25 BOLD 9698872 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 26 BOLD 9698875 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 27 BOLD 9698883 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 28 BOLD 9698885 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 29 BOLD 9698887 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> 30 BOLD 9698886 COI-5P Arthropoda Insecta Ephemeroptera
#> family_name subfamily_name genus_name species_name subspecies_name
#> 1 Baetidae Baetinae Cloeon Cloeon dipterum NA
#> 2 Baetidae Baetinae Cloeon Cloeon dipterum NA
#> 3 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 4 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 5 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 6 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 7 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 8 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 9 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 10 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 11 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 12 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 13 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 14 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 15 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 16 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 17 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 18 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 19 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 20 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 21 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 22 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 23 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 24 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 25 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 26 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 27 Baetidae Baetinae Baetis Baetis alpinus NA
#> 28 Baetidae Baetinae Baetis Baetis melanonyx NA
#> 29 Baetidae Baetinae Baetis Baetis melanonyx NA
#> 30 Baetidae Baetinae Baetis Baetis melanonyx NA
#> nucleotides
#> 1 TACTTTATACTTCATTTTTGGTGCATGAGCTGGAATAGTGGGCACTTCTTTGAGTTTATTAATTCGTGCAGAGCTAGGTAATCCTGGTTCTTTAATTGGTGATGACCAGATTTATAATGTTATTGTTACTGCCCATGCTTTTATTATAATTTTCTTTATAGTTATACCAATTATGATTGGTGGTTTTGGTAATTGATTAGTTCCTCTTATATTAGGAGCTCCTGATATAGCTTTTCCTCGTATAAATAATATAAGTTTTTGATTATTGCCTCCTTCATTGACTTTATTAGTATCAAGTAGTTTAGTAGATATAGGAGCTGGTACGGGTTGAACTGTATATCCTCCTTTAGCGGCTAATATTGCTCATGGAGGGTCATCAGTTGATTACGCTATTTTTTCTTTACATTTAGCTGGGGTATCTTCTATTTTAGGTGCTGTAAATTTTATTACAACAGTAATTAACATGCGTAGCCCTGGTATAACTTTAGATCGTATTCCTTTATTTGTATGATCTGTTGTAATTACTGCTGTGTTATTGCTTTTATCGCTACCTGTATTAGCCGGTGCTATTACTATACTTTTAACCGATCGTAATCTTAATACTTCTTTTT
#> 2 TACTTTATACTTCATTTTTGGTGCATGAGCTGGTATAGTGGGCACTTCATTGAGTTTATTAATTCGTGCGGAACTAGGGAATCCTGGATCTTTAATTGGTGATGATCAAATTTATAATGTTATTGTTACTGCTCACGCTTTTATTATAATTTTCTTTATGGTTATACCAATCATGATTGGAGGTTTTGGTAATTGATTAGTACCTCTTATATTAGGAGCACCTGATATGGCCTTCCCTCGTATAAATAATATAAGTTTTTGATTATTACCTCCTTCATTAACTTTATTAGTATCAAGTAGTTTAGTTGATATGGGAGCCGGTACAGGCTGAACAGTTTATCCTCCTTTAGCTGCAAATATTGCTCATGGAGGGTCATCCGTTGATTATGCTATTTTTTCTTTACATTTAGCTGGGGTATCTTCTATTTTAGGTGCTGTAAATTTTATTACAACAGTAATTAATATGCGTAGTCCGGGTATAACTTTAGATCGAATTCCTTTATTTGTATGATCTGTTGTAATTACTGCTGTTTTATTATTATTATCACTACCTGTGTTAGCTGGTGCTATTACTATACTTTTAACTGATCGTAATCTTAATACTTCTTTTTTTGATCCTGCTGGAGGGGGTGATCCTATTTTATACCAACATTTA
#> 3 TGGTCGGCACTTCACTTAGTCTTTTAATTCGAGCCGAGCTTGGGAACCCTGGTTCATTAATTGGCGACGACCAGATTTATAATGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTTATTATAATTTTTTTTATAGTGATACCAATTATAATTGGTGGTTTTGGCAACTGGCTGGTGCCGCTCATGTTGGGTGCGCCTGATATGGCGTTTCCACGTATAAATAATATGAGTTTTTGGTTGTTACCCCCTTCGCTGACCTTGTTGGTGTCGAGTAGAGTAGTAGATGTGGGGGCTGGCACGGGGTGAACAGTGTACCCTCCTTTAGCTGCGAACATCGCGCATGGGGGCGCCTCAGTGGATTTTGCGATTTTTTCATTACATTTAGCGGGGGTGTCTTCAATTTTGGGTGCTGTAAATTTTATCACTACTGTAGTTAACATGCGTAGTCCAGGAATAACATTAGACCGTATGCCACTATTTGTTTGGTCTGTTGTAATCACTGCGGTTTTATTATTGCTATCACTCCCTGTTCTAGCGGGGGCAATCACTATACTTTTAACGGATCGTAATTTAAACACTTCGTTTTTTGACCCGGCGGGGGGTGGCGACCCAATCTTATACCA
#> 4 TGGTCGGCACTTCACTTAGTCTTTTAATTCGAGCCGAGCTTGGGAACCCTGGTTCATTAATTGGCGACGACCAAATTTATAACGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTTATTATAATTTTTTTTATAGTGATACCAATTATAATTGGTGGGTTTGGCAACTGGCTGGTGCCGCTCATGTTGGGTGCACCTGATATGGCGTTTCCACGTATAAATAATATGAGTTTTTGGTTGTTACCCCCTTCGCTGACCTTGTTGGTGTCGAGTAGAGTAGTAGATGTGGGGGCTGGCACGGGGTGAACAGTGTACCCTCCTTTAGCTGCGAACATCGCGCATGGGGGCGCCTCAGTGGATTTTGCGATTTTTTCATTACATTTAGCGGGGGTGTCTTCAATTTTGGGTGCTGTAAATTTTATCACTACTGTAGTTAACATGCGTAGTCCAGGAATAACATTAGACCGTATGCCACTATTTGTATGGTCTGTTGTAATCACTGCGGTTTTATTATTGCTATCCCTCCCTGTTCTAGCGGGGGCAATCACTATACTTTTAACGGATCGTAATTTAAACACTTCGTTTTTTGACCCGGCGGGGGGTGGCGACCCAATCTTATACCA
#> 5 TGGTGGGGACCTCCCTCAGTCTTTTAATTCGAGCCGAGCTTGGCAATCCTGGGTCTCTAATTGGTGACGACCAAATTTACAACGTTATTGTCACTGCTCATGCGTTTATTATAATTTTTTTTATAGTGATACCAATTATAATCGGCGGGTTTGGTAATTGGCTTGTTCCGCTCATGTTAGGAGCCCCAGATATGGCATTTCCCCGCATAAATAATATAAGTTTCTGGTTGTTACCCCCTTCGCTCACACTGCTTGTATCAAGCAGTGTTGTTGATGTAGGGGCGGGCACTGGGTGGACCGTGTATCCCCCCTTGGCTGCCAACATCGCACATGGGGGTGCTTCTGTGGATTTCGCAATTTTTTCGCTACACCTGGCGGGGGTGTCTTCAATTTTGGGCGCTGTAAACTTCATTACAACTGTAATTAATATGCGCAGCCCAGGAATAACGTTGGATCGCATACCGCTATTCGTTTGGTCTGTTGTAATTACTGCGGTTTTATTACTACTTTCTCTACCGGTTCTTGCCGGGGCAATTACTATACTGCTAACTGACCGTAATTTAAATACTTCATTTTTTGATCCGGCGGGGGGAGGAGACCCAATTTTATACCA
#> 6 TGGTGGGGACCTCCCTCAGTCTTTTAATTCGAGCCGAGCTTGGCAATCCTGGGTCTCTAATTGGTGACGACCAAATTTACAACGTTATTGTCACTGCTCATGCGTTTATCATAATTTTTTTTATAGTGATACCAATTATAATCGGCGGGTTTGGTAATTGGCTTGTTCCGCTCATGTTAGGAGCCCCAGATATGGCATTCCCCCGCATAAATAATATAAGTTTCTGGTTGTTACCCCCTTCGCTCACACTGCTTGTATCAAGCAGTGTTGTTGATGTAGGGGCGGGCACTGGGTGGACCGTATATCCCCCCTTGGCTGCCAACATCGCACATGGGGGTGCTTCTGTGGATTTCGCAATTTTTTCGCTACACCTGGCGGGGGTGTCTTCAATTTTGGGCGCTGTAAACTTCATTACAACTGTAATTAATATGCGCAGCCCAGGAATAACGTTGGATCGCATACCGCTATTCGTTTGGTCTGTTGTAATTACTGCGGTTTTATTACTACTTTCTCTACCGGTTCTTGCCGGGGCAATTACTATACTGCTAACTGACCGTAATTTAAATACTTCATTTTTTGATCCGGCGGGGGGAGGAGACCCAATTTTATACCA
#> 7 TGGTGGGGACCTCCCTCAGTCTTTTAATTCGAGCCGAGCTTGGCAATCCTGGGTCTCTAATTGGTGACGACCAAATTTACAACGTTATTGTCACTGCTCATGCGTTTATTATAATTTTTTTTATAGTGATACCAATTATAATCGGCGGGTTTGGTAATTGGCTTGTTCCGCTCATGTTAGGAGCCCCAGATATGGCATTCCCCCGCATAAATAATATAAGTTTCTGGTTGTTACCCCCTTCGCTCACACTGCTTGTATCAAGCAGTGTTGTTGATGTAGGGGCGGGCACTGGGTGGACCGTGTATCCCCCCTTGGCTGCCAACATCGCACATGGGGGTGCTTCTGTGGATTTCGCAATTTTTTCGCTACACCTGGCGGGGGTGTCTTCAATTTTGGGCGCTGTAAACTTCATTACAACTGTAATTAATATGCGCAGCCCAGGAATAACGTTGGATCGCATACCGCTATTCGTTTGGTCTGTTGTAATTACTGCGGTTTTATTACTACTTTCTCTACCGGTTCTTGCCGGGGCAATTACTATACTGCTAACTGACCGTAATTTAAATACTTCATTTTTTGATCCGGCGGGGGGAGGAGACCCAATTTTATACCA
#> 8 TGGTGGGGACATCGCTCAGTCTTTTAATTCGAGCCGAGCTTGGTAACCCTGGGTCCTTAATTGGTGACGACCAGATTTACAACGTTATTGTTACTGCTCACGCGTTTATTATAATTTTTTTTATAGTGATACCAATTATAATCGGGGGGTTTGGTAATTGGCTTGTTCCCCTTATATTAGGGGCCCCCGACATAGCATTTCCCCGCATAAATAATATAAGTTTCTGGTTGTTACCTCCTTCCCTTACACTACTTGTGTCGAGCAGTGTGGTTGATGTAGGGGCGGGCACTGGGTGGACCGTGTATCCCCCCTTGGCTGCCAACATCGCGCATGGGGGGGCTTCAGTGGATTTCGCAATTTTTTCGTTACACCTGGCGGGGGTGTCTTCAATTTTGGGTGCTGTAAACTTCATTACAACTGTAATTAATATGCGTAGCCCAGGAATGACGTTGGATCGCATACCGCTATTCGTTTGATCTGTTGTAATCACTGCGGTTTTGTTATTGCTTTCTCTCCCGGTTCTCGCGGGGGCGATTACTATGCTGCTAACTGACCGTAATTTAAATACTTCATTTTTTGACCCAGCGGGGGGAGGAGACCCAATTTTATACCA
#> 9 TGGTCGGCACTTCACTTAGTCTTTTAATTCGAGCCGAGCTTGGGAACCCTGGTTCATTAATTGGCGACGACCAGATTTATAATGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTTATTATAATTTTTTTTATAGTGATACCAATTATAATTGGTGGTTTTGGCAACTGGCTGGTGCCGCTCATGTTGGGTGCGCCTGATATGGCGTTTCCACGTATAAATAATATGAGTTTTTGGTTGTTACCCCCTTCGCTGACCTTGTTGGTGTCGAGTAGAGTAGTAGATGTGGGGGCTGGCACGGGGTGAACAGTGTACCCTCCTTTAGCTGCGAACATCGCGCATGGGGGCGCCTCAGTGGATTTTGCGATTTTTTCATTACATCTAGCGGGGGTGTCTTCAATTTTGGGTGCTGTAAATTTTATCACTACTGTAGTTAACATGCGTAGTCCAGGAATAACATTAGACCGTATGCCACTATTTGTCTGGTCTGTTGTAATCACTGCGGTTTTATTATTGCTATCACTCCCTGTTCTAGCGGGGGCAATCACTATACTTTTAACGGATCGTAATTTAAACACTTCGTTTTTTGACCCGGCGGGGGGTGGCGACCCAATCTTATACCA
#> 10 TGGTGGGGACCTCCCTCAGTCTTTTAATTCGAGCCGAGCTTGGCAATCCTGGGTCTCTAATTGGTGACGACCAAATTTACAACGTTATTGTCACTGCTCATGCGTTTATTATAATTTTTTTTATAGTGATACCAATTATAATCGGCGGGTTTGGTAATTGGCTTGTTCCGCTCATGTTAGGAGCCCCAGATATGGCATTCCCCCGCATAAATAATATAAGTTTCTGGTTGTTACCCCCTTCGCTCACACTGCTTGTATCAAGCAGTGTTGTTGATGTAGGGGCGGGCACTGGGTGGACCGTGTATCCCCCCTTGGCTGCCAACATCGCACATGGGGGTGCTTCTGTGGATTTCGCAATTTTTTCACTACACCTGGCGGGGGTGTCTTCAATTTTGGGCGCTGTAAACTTCATTACAACTGTAATTAATATGCGCAGCCCAGGAATAACGTTGGATCGCATACCGCTATTCGTTTGGTCTGTTGTAATTACTGCGGTTTTATTACTACTTTCTCTACCGGTTCTTGCCGGGGCAATTACTATACTGCTAACTGACCGTAATTTAAATACTTCATTTTTTGATCCGGCGGGGGGAGGAGACCCAATTTTATACCA
#> 11 TGATCGGCACTTCACTTAGTCTTTTAATTCGAGCCGAGCTTGGGAACCCTGGTTCATTAATTGGCGATGACCAAATTTATAACGTTATTGTTACTGCCCATGCTTTTATTATAATTTTTTTTATAGTGATACCAATTATAATTGGTGGTTTTGGCAACTGGCTGGTGCCGCTCATGTTGGGTGCGCCTGATATGGCGTTTCCACGTATAAATAATATGAGTTTTTGGTTGTTACCCCCTTCGCTGACCTTGTTGGTGTCGAGTAGAGTAGTAGATGTGGGGGCTGGCACGGGGTGAACAGTGTACCCTCCTTTAGCTGCGAACATCGCGCATGGGGGCGCCTCAGTGGATTTTGCGATTTTTTCATTACATTTAGCGGGGGTGTCTTCAATTTTGGGTGCTGTAAATTTTATCACTACTGTAGTTAACATGCGTAGTCCAGGAATAACATTAGACCGTATGCCACTATTTGTCTGGTCTGTTGTAATCACTGCGGTTTTATTATTGCTATCACTCCCTGTTCTAGCGGGGGCAATCACTATACTTTTAACGGATCGTAATTTAAACACTTCGTTTTTTGACCCGGCGGGGGGTGGCGACCCAATCTTATACCA
#> 12 TGGTCGGCACTTCACTTAGTCTTTTAATTCGAGCCGAGCTTGGGAACCCTGGTTCATTAATTGGCGACGACCAGATTTATAATGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTTATTATAATTTTTTTTATAGTGATACCAATTATAATTGGTGGTTTTGGCAACTGGCTGGTGCCGCTCATGTTGGGTGCGCCTGATATGGCGTTTCCACGTATAAATAATATGAGTTTTTGGTTGTTACCCCCTTCGCTGACCTTGTTGGTGTCGAGTAGAGTAGTAGATGTGGGGGCTGGCACGGGGTGAACAGTGTACCCTCCTTTAGCTGCGAACATCGCGCATGGGGGCGCCTCAGTGGATTTTGCGATTTTTTCATTACATTTAGCGGGGGTGTCTTCAATTTTGGGTGCTGTAAATTTTATCACTACTGTAGTTAACATGCGTAGTCCAGGAATAACATTAGACCGTATGCCACTATTTGTCTGGTCTGTTGTAATCACTGCGGTTTTATTATTGCTATCACTCCCTGTTCTAGCGGGGGCAATCACTATACTTTTAACGGATCGTAATTTAAACACTTCGTTTTTTGACCCGGCGGGGGGTGGCGACCCAATCTTATACCA
#> 13 TGGTCGGCACTTCACTTAGTCTTTTAATTCGAGCCGAGCTTGGGAACCCTGGTTCATTAATTGGCGATGACCAAATTTATAACGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTTATTATAATTTTTTTTATAGTGATACCAATTATAATTGGTGGTTTTGGCAACTGGCTGGTGCCGCTCATGTTGGGTGCGCCTGATATGGCGTTTCCACGTATAAATAATATGAGTTTTTGGTTGTTACCCCCTTCGCTGACCTTGTTGGTGTCGAGTAGAGTAGTAGATGTGGGGGCTGGCACGGGGTGAACAGTGTACCCTCCTTTAGCTGCGAACATCGCGCATGGGGGCGCCTCAGTGGATTTTGCGATTTTTTCATTACATTTAGCGGGGGTGTCTTCAATTTTGGGTGCTGTAAATTTTATCACTACTGTAGTTAACATGCGTAGTCCAGGAATAACATTAGACCGCATGCCACTATTTGTCTGGTCTGTTGTAATCACTGCGGTTTTATTATTGCTATCACTCCCTGTTCTAGCGGGGGCAATCACTATACTTTTAACGGATCGTAATTTAAACACTTCGTTTTTTGACCCGGCGGGGGGTGGCGACCCAATCTTATACCA
#> 14 TGGTCGGCACTTCACTTAGTCTTTTAATTCGAGCCGAGCTTGGGAACCCTGGTTCATTAATTGGCGACGACCAAATTTATAACGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTTATTATAATTTTTTTTATAGTGATACCAATTATAATTGGTGGGTTTGGCAACTGGCTGGTGCCGCTCATGTTGGGTGCACCTGATATGGCGTTTCCACGTATAAATAATATGAGTTTTTGGTTGTTACCCCCTTCGCTGACCTTGTTGGTGTCGAGTAGAGTAGTAGATGTGGGGGCTGGCACGGGGTGAACAGTGTACCCTCCTTTAGCTGCGAACATCGCGCATGGGGGTGCCTCAGTGGATTTTGCGATTTTTTCATTACATTTAGCGGGGGTGTCTTCAATTTTGGGTGCTGTAAATTTTATCACTACTGTAGTTAACATGCGTAGTCCAGGAATAACATTAGACCGTATGCCACTATTTGTATGGTCTGTTGTAATCACTGCGGTTTTATTATTGCTATCCCTCCCTGTTCTAGCGGGGGCAATCACTATACTTTTAACGGATCGTAATTTAAACACTTCGTTTTTTGACCCGGCGGGGGGTGGCGACCCAATCTTATACCA
#> 15 TGGTCGGCACTTCACTTAGTCTTTTAATTCGAGCCGAGCTTGGGAACCCTGGTTCATTAATTGGCGACGACCAAATTTATAACGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTTATTATAATTTTTTTTATAGTGATACCAATTATAATTGGTGGTTTTGGCAACTGGCTGGTGCCGCTCATGTTGGGTGCGCCTGATATGGCGTTTCCACGTATAAATAATATGAGTTTTTGGTTGTTACCCCCTTCGCTGACCTTGTTGGTGTCGAGTAGAGTAGTAGATGTGGGGGCTGGCACGGGGTGAACAGTGTACCCTCCTTTAGCTGCGAACATCGCGCATGGGGGCGCCTCAGTGGATTTTGCGATTTTTTCATTACATTTAGCGGGGGTGTCTTCAATTTTGGGTGCTGTAAATTTTATCACTACTGTAGTTAACATACGTAGTCCAGGAATAACATTAGACCGTATGCCACTATTTGTCTGGTCTGTTGTAATCACTGCGGTTTTATTATTGCTATCACTCCCTGTTCTAGCGGGGGCAATCACTATACTTTTAACGGATCGTAATTTAAACACTTCGTTTTTTGACCCGGCGGGGGGTGGCGACCCAATCTTATACCA
#> 16 TGGTCGGCACTTCACTTAGTCTTTTAATTCGAGCCGAGCTTGGGAACCCTGGTTCATTAATTGGCGACGACCAAATTTATAACGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTTATTATAATTTTTTTTATAGTGATACCAATTATAATTGGTGGGTTTGGCAACTGGCTGGTGCCGCTCATGTTGGGTGCACCTGATATGGCGTTTCCACGTATAAATAATATGAGTTTTTGGTTGTTACCCCCTTCGCTGACCTTGTTGGTGTCGAGTAGAGTAGTAGATGTGGGGGCTGGCACGGGGTGAACAGTGTACCCTCCTTTAGCTGCGAACATCGCGCATGGGGGCGCCTCAGTGGATTTTGCGATTTTTTCATTACATTTAGCGGGGGTGTCTTCAATTTTGGGTGCTGTAAATTTTATCACTACTGTAGTTAACATGCGTAGGCCAGGAATAACATTAGACCGTATGCCACTATTTGTATGGTCTGTTGTAATCACTGCGGTTTTATTATTGCTATCCCTCCCTGTTCTAGCGGGGGCAATCACTATACTTTTAACGGATCGTAATTTAAACACTTCGTTTTTTGACCCGGCGGGGGGTGGCGACCCAATCTTATACCA
#> 17 TGGTCGGCACTTCACTTAGTCTTTTAATTCGAGCCGAGCTCGGGAACCCTGGTTCATTAATTGGCGACGACCAGATTTATAATGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTTATTATAATTTTTTTTATAGTGATACCAATTATAATTGGTGGTTTTGGCAACTGGCTGGTGCCGCTCATGTTGGGTGCGCCTGATATGGCGTTTCCACGTATAAATAATATGAGTTTTTGGTTGTTACCCCCTTCGCTGACCTTGTTGGTGTCGAGTAGAGTAGTAGATGTGGGGGCTGGCACGGGGTGAACGGTATACCCTCCTTTAGCTGCGAACATCGCGCATGGGGGCGCCTCAGTGGATTTTGCGATTTTTTCATTACATTTAGCGGGGGTGTCTTCAATTTTGGGTGCTGTAAATTTTATCACTACTGTAGTTAACATGCGTAGTCCAGGAATAACATTAGACCGTATGCCACTATTTGTCTGGTCTGTTGTAATCACTGCGGTTTTATTATTGCTATCACTCCCTGTTCTAGCGGGGGCAATCACTATACTTTTAACGGATCGTAATTTAAACACTTCGTTTTTTGACCCGGCGGGGGGTGGCGACCCAATCTTATACCA
#> 18 TGGTCGGCACTTCACTTAGTCTTTTAATTCGAGCCGAGCTTGGGAACCCTGGTTCATTAATTGGCGACGACCAGATTTATAATGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTTATTATAATTTTTTTTATAGTGATACCAATTATAATTGGTGGTTTTGGCAACTGGCTGGTGCCGCTCATGTTGGGTGCGCCTGATATGGCATTTCCACGTATAAATAATATGAGTTTTTGGTTGTTACCCCCTTCGCTGACCTTGTTGGTGTCGAGTAGAGTAGTAGATGTGGGGGCTGGCACGGGGTGAACGGTGTACCCTCCTTTAGCTGCGAACATCGCGCATGGGGGCGCCTCAGTGGATTTTGCGATTTTTTCATTACATTTAGCGGGGGTGTCTTCAATTTTGGGTGCTGTAAATTTTATCACTACTGTAGTTAACATGCGTAGTCCAGGAATAACATTAGACCGTATGCCACTATTTGTCTGGTCTGTTGTAATCACTGCGGTTTTATTATTGCTATCACTCCCTGTTCTAGCGGGGGCAATCACTATACTTTTAACGGATCGTAATTTAAACACTTCGTTTTTTGACCCGGCGGGGGGTGGCGACCCAATCTTATACCA
#> 19 TGGTCGGCACTTCACTCAGTCTTTTAATTCGAGCCGAGCTTGGGAACCCTGGTTCATTAATTGGCGACGACCAAATTTATAACGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTTATTATAATTTTTTTTATAGTGATACCAATTATAATTGGTGGTTTTGGCAACTGGCTGGTGCCGCTTATGTTGGGTGCGCCTGATATGGCGTTTCCACGTATAAATAATATGAGTTTTTGGTTGTTACCTCCTTCGCTGACCTTGTTGGTGTCGAGCAGAGTAGTAGATGTGGGGGCTGGCACGGGGTGAACAGTGTACCCTCCCTTAGCTGCCAACATCGCGCATGGGGGCGCCTCAGTGGATTTTGCGATTTTTTCATTACATTTAGCGGGGGTGTCTTCAATTTTGGGTGCTGTAAATTTTATCACTACTGTAGTTAACATGCGGAGTCCAGGAATAACGTTAGACCGCATACCACTATTTGTCTGGTCTGTTGTAATCACTGCGGTTTTATTATTGCTCTCACTCCCTGTTCTAGCGGGGGCAATCACCATACTTTTAACGGATCGTAATTTAAACACTTCGTTTTTTGACCCGGCGGGGGGTGGTGACCCAATCCTATACCA
#> 20 TGGTCGGCACTTCACTTAGTCTTTTAATTCGAGCCGAGCTTGGGAACCCTGGTTCATTAATTGGCGACGACCAAATTTATAACGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTTATTATAATTTTTTTTATAGTGATACCAATTATAATTGGTGGGTTTGGCAACTGGCTGGTGCCGCTCATGTTGGGTGCGCCTGATATGGCGTTTCCACGTATAAATAATATGAGTTTTTGGTTGTTACCCCCTTCGCTGACCTTGTTGGTGTCGAGTAGAGTAGTAGATGTGGGGGCTGGCACGGGGTGAACAGTGTACCCTCCTTTAGCTGCGAACATCGCGCATGGGGGCGCCTCAGTGGATTTTGCGATTTTTTCATTACATTTAGCGGGGGTGTCTTCAATTTTGGGTGCTGTAAATTTTATTACTACTGTAGTTAACATGCGTAGTCCAGGAATAACATTAGACCGTATGCCACTATTTGTCTGGTCTGTTGTAATCACTGCGGTTTTATTATTGCTATCACTCCCTGTCCTAGCGGGGGCAATCACTATACTTTTAACGGATCGTAATTTAAACACTTCGTTTTTTGACCCGGCGGGGGGTGGCGACCCAATCTTATACCA
#> 21 TGGTCGGCACTTCACTTAGTCTTTTAATTCGAGCCGAGCTTGGGAACCCTGGTTCATTAATTGGCGACGACCAAATTTATAACGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTTATTATAATTTTTTTTATAGTGATACCAATTATAATTGGTGGTTTTGGCAACTGGTTGGTGCCGCTCATGTTGGGTGCGCCTGATATGGCGTTTCCACGTATAAATAATATGAGTTTTTGGTTGTTACCCCCTTCGCTGACCTTGTTGGTGTCGAGTAGAGTAGTAGATGTGGGGGCTGGCACGGGGTGAACAGTGTACCCTCCTTTAGCTGCGAACATCGCGCATGGGGGCGCCTCAGTGGATTTTGCGATTTTTTCATTACATTTAGCGGGGGTGTCTTCAATTTTGGGTGCTGTAAATTTTATCACTACTGTAGTTAACATGCGTAGTCCAGGAATAACATTAGACCGTATGCCACTATTTGTCTGGTCTGTTGTAATCACTGCGGTTTTATTATTGCTATCACTCCCTGTTCTAGCGGGGGCAATCACTATACTTTTAACGGATCGTAATTTAAACACTTCGTTTTTTGACCCGGCGGGGGGTGGCGACCCAATCTTATACCA
#> 22 TGGTCGGCACTTCACTTAGTCTTTTAATTCGAGCCGAGCTTGGGAACCCTGGTTCATTAATTGGCGACGACCAGATTTATAATGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTTATTATAATTTTTTTTATAGTGATACCAATTATAATTGGTGGTTTTGGCAACTGGCTGGTGCCGCTCATGTTGGGTGCGCCTGATATGGCGTTTCCACGTATAAATAATATGAGTTTTTGGTTGTTACCCCCTTCGCTGACCTTGTTGGTGTCGAGTAGAGTAGTAGATGTGGGGGCTGGCACGGGGTGAACGGTGTACCCCCCTTTAGCTGCGAACATCGCGCATGGGGGCGCCTCAGTGGATTTTGCGATTTTTTCATTACATTTAGCGGGGGTGTCTTCAATTTTGGGTGCTGTAAATTTTATCACTACTGTAGTTAACATGCGTAGTCCAGGAATAACATTAGACCGTATGCCACTATTTGTCTGGTCTGTTGTAATCACTGCGGTTTTATTATTGCTATCACTCCCTGTTCTAGCGGGGGCAATCACTATACTTTTAACGGATCGTAATTTAAACACTTCGTTTTTTGACCCGGCGGGGGGTGGCGACCCAATCTTATACCA
#> 23 TGGTCGGCACTTCACTTAGTCTTTTAATTCGAGCCGAGCTTGGGAACCCTGGTTCATTAATTGGCGACGACCAGATTTATAATGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTTATTATAATTTTTTTTATAGTGATACCAATTATAATTGGTGGTTTTGGCAACTGGCTGGTGCCGCTCATGTTGGGTGCGCCTGATATGGCGTTTCCACGTATAAATAATATGAGTTTTTGGTTGTTACCCCCTTCGCTGACCTTGTTGGTGTCGAGTAGAGTAGTAGATGTGGGGGCTGGCACGGGGTGAACGGTGTACCCTCCTTTAGCTGCGAACATCGCGCATGGGGGCGCCTCAGTGGATTTTGCTATTTTTTCATTACATTTAGCGGGGGTGTCTTCAATTTTGGGTGCTGTAAATTTTATCACTACTGTAGTTAACATGCGTAGTCCAGGAATAACATTAGACCGTATGCCACTATTTGTCTGGTCTGTTGTAATCACTGCGGTTTTATTATTGCTATCACTCCCTGTTCTAGCGGGGGCAATCACTATACTTTTAACGGATCGTAATTTAAACACTTCGTTTTTTGACCCGGCGGGGGGTGGCGACCCAATCTTATACCA
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#> 25 TGGTCGGCACTTCACTTAGTCTTTTAATTCGAGCCGAGCTTGGGAACCCTGGTTCATTAATTGGCGACGACCAGATTTATAATGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTTATTATAATTTTTTTTATAGTGATACCAATTATAATTGGTGGTTTTGGCAACTGGCTGGTGCCGCTCATGTTGGGTGCGCCTGATATGGCGTTTCCACGTATAAATAATATGAGTTTTTGGTTGTTACCCCCTTCGCTGACCTTGTTGGTGTCGAGTAGAGTAGTAGATGTGGGGGCTGGCACGGGGTGAACGGTGTACCCTCCTTTAGCTGCGAACATCGCGCATGGGGGCGCCTCAGTGGATTTTGCGATTTTTTCATTACATTTAGCGGGGGTGTCTTCAATTTTGGGTGCTGTAAATTTTATCACTACTGTAGTTAACATGCGTAGTCCAGGAATAACATTAGACCGTATGCCACTATTTGTCTGGTCTGTTGTAATCACTGCGGTTTTATTATTGCTATCACTCCCTGTTCTAGCGGGGGCAATCACTATACTTTTAACGGATCGTAATTTAAACACTTCGTTTTTTGACCCGGCGGGGGGTGGCGACCCAATCTTATACCA
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